水泥本身就能够防渗漏，再加上树脂原料的防漏层就能够很好的防漏。
比较好的防漏产品应该是石油产品沥青，明代是有石油产品的，只是数量极少。树脂的防漏效果也不错，所以就没有特意的去寻找石油产品。
在明代，四川至少有三个地方有石油产品。一个地点在重庆南边的巴县，这里自古以来就有自己渗漏流出的石油，地名中就有“石油沟”这种名称，隋唐时代就有记载。另外两个是成都西边的邛崃县和宜宾以北的自贡，他们有共同之处，那就是人们在打天然气井时出现的副产品。明代的天然气井已经可以打到上千米的深度了。地下的油气往往是并存的，所以有的井就冒出了石油。
古代的人们还不懂得石油炼制技术，也不知道石油产品的价值，所以石油至多被当做燃料，基本上是废弃之物。没有人重视，也没有人开采利用、炼制它。
对于排水问题，朱万化给出的建议就是蒸汽机动力的抽水泵。一年之中用不了几次，并且水量不大，这是最简单有效的方法。
考虑到建一条隧道不容易，要尽量的充分利用它，因此，建设的时候，它就是两个隧道孔，一个孔是双轨的铁路（跨过运河的这个区段是双轨），另一个孔是给公路准备的，马车可以通行。
因为运河隧道长度短，整体工程不大，三个月后隧道工程完工，又用了两个月挖掘新的运河河道，堵塞老河道，到七月份，隧道工程就圆满结束了。
隧道封顶部分全长约150米，隧道照明的普通办法就是灯，但是这个年代没有电灯，用油灯管理上就要麻烦一些。为此朱万化想到了一个办法，就是使用通信的那种反光的大锅来获取阳光，折射到隧道中。为了避免长长的光柱进入隧道会强烈的刺眼。光通过封闭的粗管道进入隧道，在隧道中部用凸镜反射，使光线散射开来。每一孔隧道两个反射装置，在隧道中开两个散射光线的窗口。白天隧道中就不需要照明了，光亮的强度足够了。到了夜间，点上两盏灯，是充气的气死风灯，隧道里面行路也没问题。
朱万化知道：传递光，最简单可靠，效率最高的还是玻璃纤维，一条光缆可以方便的传递足够的光照，但是两端的设备，即采集光和发散光的设备，超出了朱家目前的制造能力，只好采用比较笨的折射光的办法。
为了维护隧道和保护隧道的安全，隧道有一个十人的维护队和一个班的武警守卫，共二十人。
运河与铁路、公路立体交叉，在中国这是创纪录的，不少人都感到新奇，纷纷前来观看这个水下的道路。最先利用起来的，就是公路隧道，马车可以方便地通过运河，还是极大的便利了运输。当然铁路公司会收取过路费，收费不多，起码可以支付维护隧道的费用。
运河上的桥梁不多，济宁就有一座桥，再向北就要到德州才能有桥。但是这种桥是起拱桥梁，坡度太大，负重的马车是不能通过的。所以这处隧道还是很重要的。
修建隧道还引出了河道衙门的一段故事。前面我们说过，朝廷的河道衙门是在济宁的，河道衙门管理的河务就是运河北段，即京师到扬州的河段，以及黄河中下游的河道、河堤。运河的长江以南河段以及长江的河务由南京的工部管理。
黄河的河堤经过崇祯五年、六年的工程已经很完善了，河道衙门就剩下一个不断的巡视的任务，所以河道衙门目前的主要差事就是维护运河了，差事少了，工程款也就少了。
在运河上修隧道，属于河道衙门的管理范围，当然要有河道衙门参与，联省衙门依旧按照两年前黄河工程的旧例，聘请河道衙门的官员，给了他们三个官员的名额参与工程管理，给予工程补贴。这等好事当然轮不到别人，河道都御使等主官就占据了这三个名额。
前边有黄河河堤工程的旧例，这次又有隧道工程的新例，于是就强烈的刺激了河道衙门的官员，特别是河道衙门处于山东境内，山东官员的待遇他们非常清楚。
属于联省的官员薪俸很高，差不多是朝廷同级官员二倍以上，并且与公务有关的支出项，官府衙门全部负担了，不必官员自己掏腰包。
朝廷的官员是靠灰色收入和贪墨来补充收入不足的，河道衙门与税收等事无关，只有贪墨工程款这一项了。现在黄河的工程几乎没有了，就剩下了运河，工程款被砍掉一半以上，自然就严重地影响了他们的收入。
于是，河道衙门的不少官员开始议论纷纷，他们希望把河道衙门归属到联省衙门的管辖之下，这是个人利益的驱使，都御使本人也不例外。
朝廷的河道衙门与联省衙门没有任何关系，他们的意见如何转达呢？最终河道衙门的官员们写出一份请求的文案，通过联省工房监督隧道工程的官员呈报到洪承畴那里。
洪承畴感觉这种事情的确有点荒唐了，如果他们只是管理黄河河道，那是没得说，完全在联省范围之内，应该收归联省管理。但是运河只有一小段在山东境内，并且还是河道衙门的主要业务，这个衙门如何收得？何况还有每年的工程拨款，朝廷该花费的银子转嫁到联省身上，这如何使得？于是洪承畴就驳回了，只是连同其他公文，有个节略呈报到督军那里。
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