同样都是以“效忠天皇”为信仰的部队，他们之间却发生过很多次匪夷所思的冲突，演习中的陆军士兵直接用枪口瞄准身穿白色常服的海军军官，海军学院的学员在门口架起沙袋铁丝网抗击陆军学院学员的上门挑衅，甚至出现过双方禁止彼此军士通婚的情况。
之所以出现这种奇葩现象，主要有三大原因。
首先是出身阶级问题。
东瀛的海军作战人员，大多数都是出身于富裕的家庭当中，他们认为自己才是东瀛的未来，这就使得他们对于陆军根本看不顺眼。
东瀛陆军的作战人员则大部分来自贫困人家，他们也认为自己是东瀛的中坚力量，这样使得陆军对海军根本看不上眼。这就导致在二战当中，这两大兵种之间的配合非常的少。
其次是资源和利益之争。
东瀛的国土面积并不大，这就导致它的资源非常的短缺，在这样的情况下，东瀛就必须对资源进行合理的分配。这时陆军和海军便因为抢夺资源产生了大量的矛盾，这也就是为何东瀛会有“北上”和“南下”两种不同的作战战略，都是为自己获得大量资源发展而斗争。
在整个二战期间，东瀛的海陆军一支在互相拆台，直到战争末期！
最后是历史原因。
海陆两大派系的不合，可以追溯到倒幕运动时期。当时东瀛之所以倒幕运动能够胜利，全靠背后的萨摩和长州两大强藩在支持。虽说最终由这两大强藩最终胜出，并且东瀛的政坛也是由他们两大派系所把持，但是两者之间并不是没有矛盾的。当时的陆军是长洲所把持，海军则是由萨摩所把控，这就使得军队中有两大派系力量，矛盾也由此延续下来！
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