原道宁把圣战军整编的最终方案送到凤九渊的手头后，他又作了一些小幅度的修改。毕竟自己现在还能控制局势，如果不趁着这时候多作点事，等到权力不在自己手里后，再想改变什么就难啰。
对整编方案修改的第一点是：军事委员会共设立委员13名，其中国会3个名额，凤舞1个名额，剩下9个名额全由军队高级将领担任。军委不常设立，只有遇到国家危机或是有战事时才组建，平时由军委下辖的参谋联席会议负责对军队的管理。参联会责任人为凤舞，其他有46名军队高将担任参联委员，日常工作凤舞不兼管，由参联会副主席和参联委员会主持。军委一旦设立，将受到国会全程监督，国会没有权力干预军委的工作。危机解除或战争结束，军委必须在36个月内解散。如果不解散，国会有权冻结军委申请的所有预算划拨，凤舞也将冻结所有命令的执行。
在这一点的修改之上，凤九渊可谓是良苦用心。他先是和在建国筹备委员会里担任自己代表的杨善谈了整整一天一夜，又综合了有史以来各种的军事制度作为考证，这才形成了最终的修改意见。
他的修改标准是首先保证国家的安全性，其次才是军队的独立性，其他需要考量的是国会必须对军队起到足够的监督和制衡，但又不至于影响到军队的日常工作。
说实话，站在他本人的角度，确实讨厌政治干涉军事，以政治为目的的各种战争。都说战争是政治的延伸，他是不同意这一点的。现在人类已经统一，科拉米亚不会跟人类发生碰撞，除非是人类主动发起挑衅。所以，合众国政治的所有目的就是管理好国家和服务好人民，舍此之外，便是党派团体之间的斗争了。在凤九渊的构想里，内部的政争怎么搞都可以，纵横连合，倾轧暗杀都行，但只要不动用军队，作为国家主体的人民就不会受到根本性的伤害，只要守住了这条底线，政争怎么闹都在容忍的范围之内的。
第一个难题得到解决之后，接下来还有一个更大的难题，这个难题的根本其实就是人性的缺点，原道宁解决不了，凤九渊更不认为自己会有什么办法。利益是无处不在、无孔不入的，只要是人，就会有经不起利益诱惑的时候，所以不论是政客还是军人，都会在利益面前腐败堕落。一旦军队背后站上了利益集团，国会背后也有了利益集团，谁又能保证国家不会再次走上动乱的道路？
当然，凤九渊不认为这些问题可以在自己手里一劳永逸地得到解决，他只想制定一种制度，形成有效的制约，从而尽可以长地保证国家的稳定与和平，同时这种制度能够对腐败和堕落形成有效的威慑和打击，并能够在一定程上治疗国家所遭受到的伤害。
为了降低军队被利益集团控制的机率，他制定了两种选举制度。一种是参联会委员的选举，只在军队内部无记名举行，选举过程由凤舞负责，总督察院监督，以确保真正有能力的将领能够上位；而高官的选举范围从军队扩大到整个国家，与国会代表的选举一样，每五年定期举行一次，没有战争的情况下高官只是一个荣誉头衔，一旦发生战争，他们将在最短的时间内组成军事委员会，统帅军队。
总的来说，这些手段并不能完全抑制各种弊端，但能有效的降低，这已经令凤九渊很满意了。
在他设计新军事制度的同时，建国筹备委员会那边也设计出了全新的监察和法院制度。
用近20000名代表的话来说，人民才是国家的主体，国会也好，政府也罢，都是为人民服务的机构，而不是凌驾于人民之上的管理者和统治者。所以，在制定新的合众国宪法时，所有代表一致同意将民权致上写进了《大宪法》的第一条。有了这个基础，机构的设立和法律的制定都得循着这一条基本宪章来，因此，在设立总督察院和最高仲裁委员会时，绝大多数代表都同意让它们与国会的平级，确保了其权威性和独立性。
凤九渊也是在参照了建国筹备委员会对国会、国家行政中心、总督察院和最高仲裁委员会的设立条例后，才最终确定了新的军事制度。
当然，确定之后，他并没有立即交出去让建国筹备委员会讨论，而是先征询了圣战军全体将士的意见。得到了全票肯定后，他并没有因此而觉得它就是可行的了，而是又抽空请教了奥.沙利文、罗德蒙等一干老将名将，还有其他的一些知名的学者和专家，大家都认为这个方案与当下合众国的体制和建国筹备委员会的代表们的想法不谋而合，是最好的，可以提交投票决议了。
饶是如此，他还是觉得工作做得不够，又让孔直、布什、耶如玉和鲁博姆抽空帮他审阅了这个方案，得到他们的赞许之后，他这才觉得基本差不多了。
在正式将方案提交给建国筹备委员会后，他依旧有些担心，怕遭到代表们的反对。要知道自打人类建立军队以来，他就没有独立存在过的先例，也不知道他们是会对这个方案感到惊恐呢还是疑惑，亦或是明目张胆的反对？
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