王忠下令将郑杜与郑松三子一并处死，连同郑氏家族成员及臣僚尽数斩草除根，彻底清洗后黎朝势力，后黎朝土皇帝黎维潭及其宗室也被安南国王陈丰下令尽数诛杀，后黎朝彻底灭亡。
陈阿靖、王忠、刘忠信按照陈瀚旨意，将安南国故地分而治之，广西经略陈阿靖兼任安南都统使，统管红河以东地区，交趾督军兼安南国大将军刘忠信统管横山以南地区，交趾布政使兼安南国丞相王忠统管横山以北，红河以西地区，安南国迁都清化，加封安南国王陈丰交趾大都督，赏赐土地两万石。
刘忠信率五万大军南下顺化府、西贡府驻守，陈阿靖、王忠随即出兵征讨割据安南都统使司、安南国北部一带的郑氏残余势力，将其尽数歼灭，所剩不多的莫朝旧臣也得到陈阿靖重用，管理一方政务，但军权却掌握在汉军驻军将领手中，王忠也在中部安南国境内提拔安南人做官，管理地方政务，但军权由汉人将领掌握。
明军撤退出交趾，明朝在红河三角洲安置的三十万汉人移民大多遭到后黎朝屠杀，只有少部分被融合进安南人中，明朝汉化安南的企图随着明军撤退彻底失败，陈瀚因此下令对后黎朝君臣赶尽杀绝，已报此仇。
安南国看似表面上一统，实则被分为南、中、北三部分分而治之，安南国已是名存实亡，天汉朝廷需要用时间来巩固对安南国交趾省的统治，拉拢融合地方势力为我所用，严厉镇压反叛势力。
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